Die Protagonisten, die Kadic-Gymnasiasten, sind erneut gezwungen, gegen ihre Feindin Xana zu kämpfen. In der Vergangenheit schienen sie ihre Feinde im Laufe ihrer Abenteuer erfolgreich besiegt zu haben, aber jetzt hat jemand oder etwas ihren verhassten Feind wieder zum Leben erweckt. Die Protagonisten Ulrich, Jeremy, Aelita, Yumi und Odd erhalten wieder Zugriff auf ihre Superausrüstung, um die Ursache für Xanas Wiederbelebung zu untersuchen und die Erde erneut vor bösen Angriffen zu retten.